Учебный центр микробиологии и биотехнологии

на базе Института биохимии и физиологии микроорганизмов имени Г.К. Скрябина РАН

Магистерская образовательная программа "Микробиология и вирусология"
Направление: 510600 - Биология

Декан УЦ и руководитель МОП - д.б.н. Леонтьевский Алексей Аркадьевич
Телефон: 73-29-23
Факс: (495) 956-33-70
Е-mail: leont@ibpm.pushchino.ru

Пом. декана: Кривошеева Лариса Владимировна
Телефон: 73-16-68
Е-mail: larkriv@mailgate.ru

Учебный центр (факультет) микробиологии и биотехнологии Пущинского государственного университета создан в 1993 году и функционирует на базе Института биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН. УЦ осуществляет обучение в рамках магистерской образовательной программы "Микробиология и вирусология". В учебном процессе и научно-исследовательской работе магистрантов используется материально-техническая база, научно-производственный и интеллектуальный потенциал ИБФМ РАН. В учебной и учебно-вспомогательной работе по подготовке магистров принимают участие практически все структурные подразделения института. Обучение имеет целью подготовку специалистов в области общей и прикладной микробиологии, использования деятельности микроорганизмов в биотехнологии, в том числе в целях очистки окружающей среды от разнообразных антропогенных загрязнений. На лекциях, семинарах и в лабораториях обучающиеся знакомятся с биоразнообразием мира микробов, приемами характеристики новых микроорганизмов, их всестороннего биохимического, физиологического, генетического и цитологического изучения. Магистранты осваивают современные микробиологические, биохимические и молекулярно-биологические методы, используемые в различных областях фундаментальных исследований биологии. Полученные знания позволяют выпускникам успешно трудиться во многих направлениях современной микробиологии и биотехнологии.

Разработка, реализация и совершенствование магистерской программы "Микробиология и вирусология" происходит по следующим основным направлениям:

• Микробное разнообразие и его ресурсы.
• Физиолого-биохимический потенциал микроорганизмов во взаимодействии с окружающей средой.
• Молекулярные механизмы функционирования генетических систем микроорганизмов.
• Использование микроорганизмов в биотехнологии.

Проблемное поле МОП "Микробиология и вирусология":

• теоретические основы и актуальные проблемы сравнительно-эволюционной, экологической и промышленной микробиологии;
• физиология, цитология, биохимия и генетика микроорганизмов, их систематика и эволюция;
• вирусы, бактерии, археи и грибы. Методические подходы к их изучению и использованию в биотехнологии;
• культивирование, сохранение и идентификация микроорганизмов;
• генетические и физиологические аспекты взаимодействия микроорганизмов с ксенобиотиками;
• взаимодействие микроорганизмов с растениями;
• синтез микроорганизмами биологически активных веществ, ферментов и полимеров клетки.

Примеры исследований в рамках МОП "Микробиология и вирусология"

• установление роли первичной структуры белка и фосфолипидов мембран в обеспечении топогенеза и биогенеза секретируемых белков;
• изучение генетического контроля образования азотфиксирующих клубеньков бактериями, биосинтеза феназиновых антибиотиков у ризосферных псевдомонад, клонирования и суперэкспрессии энантиоселективных гидратаз и амидаз из грамположительных бактерий;
• изучение биологии бактериальных плазмид (распространения, функциональной значимости, организации, роли в детерминировании процессов биодеградации ксенобиотиков, устойчивости к антибиотикам и тяжелым металлам, влияния на синтез вторичных метаболитов и т.д.);
• изучение биологического разнообразия микроорганизмов, поиск и описание новых форм, установление их положения в филогенетической системе, совершенствование иерархической классификации микроорганизмов;
• изучение биоразнообразия аэробных метилотрофов и реализация их биотехнологического потенциала для целей биосинтеза различных продуктов и биодеградации токсичных одно- и полиуглеродных соединений;
• теоретическое и экспериментальное развитие биосенсорной методологии и создание моделей биосенсорных анализаторов на основе электрохимических преобразователей - полевых транзисторов, светоадресуемых сенсоров и амперометрических преобразователей;
• исследование алкалоидообразования у микроскопических грибов;
• изучение влияния различных абиотических факторов (магнитного поля, окислительно-восстановительного потенциала и т.д.) на активность микроорганизмов;
• изучение методов ускоренного прогноза культивируемости бактерий после низкотемпературного замораживания, изучение механизмов взаимодействия флуоресцентных зондов с микроорганизмами разных таксономических групп, изучение механизмов действия киллер-токсинов базидиомицетных дрожжей;
• создание научных основ использования генетически модифицированных микроорганизмов в биотехнологиях защиты окружающей среды от загрязнений;
• очистка сточных вод от тяжелых металлов и поверхностно-активных веществ, защита окружающей среды от загрязнений нефтью и нефтепродуктами;
• микробиологическое повреждение технологических конструкций.

Магистерская образовательная программа включает фундаментальные дисциплины по направлению и спецкурсы:

• Положение микроорганизмов в системе живых существ и современные предствления об их эволюции
• Основы физиологии роста и культивирования микроорганизмов
• Основы биохимии микроорганизмов
• Биокинетика
• Изотопная микробиология
• Структурно-функциональная адаптация микроорганизмов
• Биоразнообразие аэробных метилотрофов
• Полифазная таксономия и идентификация микроорганизмов
• Микроорганизмы в геохимических круговоротах
• Жизнеспособность микроорганизмов в природе и лаборатории
• Микроорганизмы и процессы биоповреждений
• Количественный анализ деятельности микробных популяций
• Биология одноклеточных грибов
• Генетический пул микробных популяций и их адаптация к условиям среды
• Генетика биодеградации
• Молекулярные механизмы генетических процессов у микроорганизмов
• Бактериофаги
• Методы генной инженерии и биотехнологии
• Системы рестрикции-модификации ДНК
• Вторичный обмен и синтез биологически активных веществ микроорганизмов
• Биотехнология очистки антропогенных загрязнений окружающей среды
• Биоремедиация почв
• Биосенсоры: теоретические основы и практическое применение
• Масштабирование технологических процессов культивирования микроорганизмов

В реализации МОП "Микробиология и вирусология" принимают следующие научные подразделения института:

• Отдел "Всероссийская коллекция микроорганизмов"
  заведующий - д.б.н. Евтушенко Людмила Ивановна
• Лаборатория структурно-функциональной адаптации микроорганизмов
  заведующий - д.б.н. проф. Дуда Виталий Иосифович
• Лаборатория регуляции биохимических процессов
  заведующий - д.б.н. Кулаковская Татьяна Валентиновна
• Лаборатория биохимии клеточной поверхности микроорганизмов
  заведующий - к.б.н. Степная Ольга Андреевна
• Лаборатория биологии плазмид
  заведующий - член-корр. РАН проф. Боронин Александр Михайлович
• ВНТК структурно-функционального анализа генетических систем микроорганизмов
  заведующий - к.б.н. Солонин Александр Сергеевич
• Лаборатория аэробного метаболизма микроорганизмов
  заведующий - к.б.н. Моргунов Игорь Григорьевич
• Лаборатория анаэробного метаболизма микроорганизмов
  заведующий - д.б.н. проф. Акименко Василий Константинович
• Лаборатория микробиологической трансформации органических соединений
  заведующий - к.б.н. Донова Марина Викторовна
• Лаборатория микробной энзимологии
  заведующий - д.б.н. Леонтьевский Алексей Аркадьевич
• Лаборатория энзиматической деградации органических соединений
  заведующий - д.б.н. проф. Головлева Людмила Алексеевна
• Лаборатория радиоактивных изотопов
  заведующий - д.б.н. проф. Троценко Юрий Александрович
• Лаборатория физиологии микроорганизмов
  заведующий - д.б.н. Вайнштейн Михаил Борисович
• Лаборатория биосенсоров
  заведующий - д.х.н. проф. Решетилов Анатолий Николаевич